1電源的影響
由于電壓的不穩定所形成的電磁干擾會造成基礎型氣相色譜儀工作基線的不穩定，產生基線漂移、不平滑等干擾因素，影響測量結果:
并對氣相色譜微機系統程序產生影響，嚴重時會引起溫度失控，從而燒壞色譜柱檢測器加熱裝置。因此，工作人員操作時不能大
一旦發現失控，應立即關斷電源。同時，建議給基礎型氣相色譜儀(功率3000W)配置功率5000W的穩壓器，使用獨立電源，還須保證穩壓器的接地點與氣相色譜儀的接地點相連后，再與大地相連。
簡單:
2環境條件的影響
基礎型氣相色譜儀對環境溫度要求并不高，一般在5~35℃的室溫條件下即可正常操作。但對環境濕度要求一般在20~85分范圍內為商。
在高潮濕地區，使用氫火焰商子化檢測器時，因濕度大會引起放大器絕緣性能下降，若在高靈敏度擋上操作時，會產生響應值下降
遇到上述問題時，實驗操作者應采取必要措施，把溫度和濕度控制在實驗條件允許的范圍內。
3載氣純度的影響
氣相色譜儀所用的氣源純度要求在分99.99以上。目前，許多教學者對不同檢測器所用氣源純度沒有引起足夠注意，因氣源純度不高可能導致檢測器靈敏度下降與基線不穩，
實驗證明，如果氫氣的純度達不到9999，熱導檢測器的靈敏度就不可能達到3000~5000mVmL/mg.
如果用純度為98的氫氣作氫火焰離子化檢測器的燃氣氣源，可能由于氬氣純度不夠(含有甲烷等可燃性氣體)，使儀器在檢測器的104兆歐靈敏度擋上點火使用時，產生基線嚴重不穩，好象有永遠出不完的色譜峰。
由此可見，在選擇載氣時一定要嚴格要求，務必使載氣的純度達到99.99以上。
